突变文库构建
分子定向进化是人为地模拟自然进化机制,利用现代分子生物学方法创造大量的突变同源基因文库,采用灵敏的定向筛选策略,创造出自然界并不存在的或某些特性有显著改变的突变蛋白质或其他生物分子。分子定向进化已广泛应用于蛋白质的分子改造,被认为是生产具有改良或全新特性的蛋白质和调控序列的高效方法。
DNA文库可以改变蛋白质的特定位点或者DNA的调控区域,可以用来研究结构和功能之间的关系。根据不同设计目的,体外合成的文库可以更精确更随意的控制所研究序列的多样性。而且,合成的DNA文库可以显著提高获得核酸或蛋白质突变体的效率和下游研究。宝吉生物可以合成客户自己设计的各种DNA文库,也可以根据需要帮助客户设计合成所需的文库。
请联系我们咨询文库设计。
突变文库构建服务特色
多种文库类型,包括扫描文库, 简并文库,三联体文库等
无差错基因合成-保证100%序列正确
根据客户需求合成文库-您可以自己设计,也可以让宝吉生物的专家团队设计
文库可以多种形式发货,克隆,双链DNA片段或者引物
DNA克隆根据客户需求以载体或者其他形式发货
序列100%验证正确,文库多样性充分保证
合成DNA文库的类型:
1)丙氨酸扫描文库(Alanine Scan Library)
通过用丙氨酸逐一取代每一个位置或关键位置的氨基酸,发现对蛋白功能、相互作用和形态具有重要功能的氨基酸残基。
定点饱和突变文库(Site Saturation Library)
任一位点包含所有20种氨基酸,用于检测蛋白的一级结构与结构和功能之间的关系。
2)简并突变文库(Degenerated Substitution Library)
构建简并碱基突变文库对蛋白某一位点或某几位点、甚至某些功能区域进行结构和功能分析。
3)氨基酸随机突变文库
通过我们独特技术,实现可控、高精度的随机化突变合成(A,T,C,G四种碱基在每个突变位点都更趋于均匀性)。随机突变频率可以精确控制在1-4个突变/kb,4-8个突变/kb,和8-12个突变/kb中任意一种形式。
应用领域:
研究工业酶的活性与结合位点关系
研究蛋白质的结构与功能的相互作用
提高蛋白质性质(活性增强、半衰期延长、稳定性增加)
交付结果:
10ug线性随机PCR产物文库(高达1011次方随机突变克隆)
10ug随机突变克隆文库(高达109次方随机突变克隆):亚克隆目标载体
随机克隆测序报告(12个)
4)抗体文库(Antibody Library)
合成多样性高的抗体文库,提高抗体特异性、免疫原性、亲和性等。
5)模块替换文库(Modular Substitution Library)
拼接多种DNA元件(包括调控区或者编码区)构建各种遗传模块/区域或者通路。
合成DNA文库交付标准
| 单链引物文库 Pooled ss Oligo Libraries | 双链PCR产物文库 Pooled ds PCR Libraries | 克隆文库 Pooled Cloning Libraries | 测序验证过的单克隆文库 Error Free Separated Colonies Libraries |
长度 | 125nt左右 | 3kb左右 | 高达109个克隆 | 高达1百万个装在96孔板中的克隆 |
发货形式 | 简并引物或者三联体碱基引物混合物 | 多样性的PCR片段混合物 | 多样性混合克隆文库 | 测序验证过的100% 正确的克隆 |
复杂度 | 可以包含高GC或低GC区, 连续重复,同聚体,回文结构 | 30-70%GC含量,无重复序列 | 可以包含高GC或低GC区, 连续重复,同聚体,回文结构 | 可以包含高GC或低GC区, 连续重复,同聚体,回文结构 |
客户载体 | – | – | 可以将文库克隆到客户提供的载体上 | 可以将文库克隆到客户提供的载体上 |
质量保证 | Sanger测序或NGS测序验证多样性 | Sanger测序或NGS测序验证多样性 | Sanger测序或NGS测序验证多样性 | Sanger测序或NGS测序验证多样性 |
价格和交付时间
长度(nt/kb) | 难度评估 | 多样性测序分析 | 引物或者PCR片段量 | 质粒/菌液量 | 单克隆质粒量 | 单链引物文库 | 双链PCR产物文库价格 | 混合克隆文库价格 | 交付时间 |
0.02-0.125 | √ | √ | 10 nmol | – | – | Inquire | – | – | 8-15工作日 |
0.125-3.0 | √ | √ | 2μg | 20-100μg/1-5ml | 1-5μg | – | ¥1.5/bp+简并/三联体价格 | ¥1.5/bp+简并/三联体价格 | 8-15工作日 |
1.5-3.0 | √ | √ | 2μg | 20-100μg/1-5ml | 1-5μg | – | ¥2.0/bp+简并/三联体价格 | ¥2.0/bp+简并/三联体价格 | 8-15工作日 |
3.0-6.0 | √ | √ | – | 20-100μg/1-5ml | 1-5μg | – | – | ¥2.5/bp+简并/三联体价格 | 20-40工作日 |
6.0-9.0 | √ | √ | – | 20-100μg/1-5ml | 1-5μg | – | – | ¥3.0/bp+简并/三联体价格 | 30-50工作日 |
>9.0 | √ | √ | – | 20-100μg/1-5ml | 1-5μg | – | – | ¥3.5/bp+简并/三联体价格 | 询价 |