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基因组酵母双(单)杂交文库构建
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现进行优惠促销,欢迎来电洽谈。免费赠送3个读码框处理,以确保蛋白可以正常表达。 可以选择提供转化到酵母的文库,可以提供足够100次筛选的酵母转化菌液文库,同时还会提供质粒文库。 服务时间:25个工作日内 服务报价:
“自1989年Field等人建立了第一个基于酵母的细胞内检测蛋白相互作用的系统以来,酵母双杂交系统已经越来越多的应用于鉴定新的蛋白与蛋白相互作用,鉴定蛋白级联底物以及鉴定突变对蛋白与蛋白结合的影响等。有文献统计,目前已知的蛋白质相互作用至少有一半是通过酵母双杂交实验发现的!” 而文库筛选结果直接由文库质量的好坏所决定,构建出高质量的文库是得到好的筛选结果的关键因素。 我们拥有多年的文库构建经验,已完成数千个各类文库构建,所采用的技术以及试剂盒均为市场上高质量的文库构建试剂,我们构建文库的成功率为98%以上。
原始文库库容量大于1*10^7CFU; 1.我们是采用同源重组的方法构建文库,没有经过任何的内切酶切割和连接过程,确保不会出现基因被酶切切断的情况,能够保证基因的完整性,而Clonetech的是用酶切连接的方式构建的。 2.由于我们采用的是重组的方式把cDNA重组到载体上,相对clonetech的SMART的T4连接酶的方法效率要高的多,我们承诺原始库的库容量在1*10^7以上。而且重组的方式假阳性很低,我们这里有的客户一次测3万个克隆,都没有出现一个空载的情况,我们承诺阳性率大于98%,这是酶切连接的方法远远无法比拟的。
文库构建流程: 1.与Clonetech(Takara)的SAMRT方法技术比较:
2. 与invitrogen的构建方法比较
四、交付结果: 我们的酵母双杂交文库可以自由选择使用pGADT7(Clonetech,推荐)或者pDEST22(invitrogen)载体,交付的产品如下:
六、材料要求: 七、客户案例: 目前我们已经成功完成数千个不用样本的文库构建,主要客户为中国科学院上海植物生理生态研究所、上海交通大学、浙江大学、浙江省农科院、山东省农科院等多家单位完成酵母双(单)杂交文库构建服务,物种包括人、小鼠、大鼠、水稻、拟南芥、牡丹、稻飞虱、苹果、油菜、小麦、贝壳、葡萄、真菌等。 八、文库筛选: 1.诱饵载体的测序验证以及构建到双杂交筛选载体上 九、FAQ: 9.1. 如何选择合适的文库构建方法进行建库? 我们是可以同时提供3种文库构建方法的公司,这也足以看出我们公司的技术实力。 1) Clonetech 的SMART方法,该方法基本是被淘汰的,我们上文有详细的技术比较,其为数不多的好处就是RNA的起始量可以很小,一般只需要几ug即可,该方法成本很低,一般不建议选择。 2) Invitrogen的方法,该方法质量上较SMART方法要好很多,其对试剂的质量要求也很高,需要全部使用invitrogen的原厂试剂。我们全部使用invitrogen公司试剂进行构建,且做了一些技术改进,提高了文库质量。该方法对起始的RNA要求较高,建议起始用量是大于200ug。但该方法有一个严重的缺点,就是需要进行两次重组才能得到酵母文库,而多一次重组就会多一次文库扩增过程,会严重影响文库质量。在上文中有详细的技术比较和介绍。 3) All-Direct方法,这个是我们的改进方法,是在invitrogen方法上做了重要改进,保留了其优点(不用PCR扩增,文库保真度高),去除了其需要经过两次重组的缺点,大大提高文库质量。平均长度较invitrogen方法可以提高200bp,库容量可以提高10倍以上。该方法对RNA的要求量和invitrogen方法一样。 9.2. 宝吉生物提供的酵母双杂文库有哪些产品内容? 我们提供的文库产品,包含了文库质粒(大于500ug)以及大肠杆菌文库甘油菌。同时可以选择提供转化到酵母细胞的文库甘油菌,我们会提供100只转化到酵母细胞的文库甘油菌,可以做100次的文库筛选。 9.3. 如何检测文库质量? 对于文库的质量,一个简单的金标准就是,样本内的所有基因都在文库里,且基因要有一半以上的全长基因,这个文库就是合格的。 9.4. 如何评价文库质量? 文库质量的关键指标,主要是文库库容、空载率及插入片段平均长度。 9.5. Mating和共转两种筛库方法哪种好? 共转和maiting两种方法,结果是一样的,只是一个文库质粒转到酵母细胞的方法,对于后续的文库筛选没有区别的,可以根据老师的实验习惯,自由选择的。 9.6 公司文库构建经验有多久? 本公司从事各类文库构建和筛选长达10多年,特别是酵母文库,是国内一直自己做文库构建和筛选的公司。不像有的公司宣称有10多年文库构建经验,实际上真实情况是其invitrogen系统的文库构建经验只有2-3年,2-3年前其所有的invitrogen系统文库都是外包给某公司做的,只是个二道贩子而已,由于自己一直做不好,才不得不一直外包。文库构建和筛选,经验很重要,长的经验积累,可以保证产品质量和稳定性,一次成功率等。 十、客户文章示例 核蛋白酵母双杂交文库客户文章示例: 【1】Yeast-2-Hybrid data file showing progranulin interactions in human fetal brain and bone marrow libraries[J],Data in Brief, Volume 9, December 2016, Pages 1060-1062 【2】Zhenhai Yu, Yingying Ge, Lei Xie,et al. Using a yeast two-hybrid system to identify FTCD as a new regulator for HIF-1α in HepG2 cells[J],Cellular Signalling, Volume 26, Issue 7, July 2014, Pages 1560-1566 【3】Zhanyang Yu,1 Ning Liu,1 Yi Wang,2 Xiaokun Li,et al. Identification of Neuroglobin-interacting Proteins Using Yeast Two-hybrid Screening. Neuroscience. 2012 Jan 3; 200: 99–105. 【4】Cui LG, Shan JX, Shi M, et al. DCA1 Acts as a Transcriptional Co-activator of DST and Contributes to Drought and Salt Tolerance in Rice. PLoS Genet. 11, e1005617 (2015). 【5】Jing Ning, Baocai Zhang, Nili Wang, Increased Leaf Angle1, a Raf-Like MAPKKK That Interacts with a Nuclear Protein Family, Regulates Mechanical Tissue Formation in the Lamina Joint of Rice. The Plant Cell, Vol. 23: 4334–4347, December 2011. 【6】Raksha Singh, Mi-Ok Lee, Jae-Eun Lee, Jihyun Choi, Rice Mitogen-Activated Protein Kinase Interactome Analysis Using the Yeast Two-Hybrid System. Plant Physiology, September 2012.Vol.160, 【7】X.F.Zha,M.Zhao, C.Y.Zhou, H.Z.Guo. Analysis of interaction between Bmhrp28 and BmPSI in sex-specific splicing of Bombyx mori Bmdsx gene. Genetics and Molecular Research 13 (3): 5452-5462 (2014) 【8】Chao Zhang, Rongchao Ge, Junwen Zhang, Identification and Expression Analysis of a Novel HbCIPK2-Interacting Ferredoxin from Halophyte H. brevisubulatum.PLOS. December 4, 2015. 【9】Deng X1, Guo D2, Yang S1, Shi M1, Chao J1, Li H2, Peng S2, Tian W1. Jasmonate signalling in the regulation of rubber biosynthesis in laticifer cells of rubber tree, Hevea brasiliensis. J Exp Bot. 2018 Jun 27;69(15):3559-3571. doi: 10.1093/jxb/ery169. 酵母单杂交文库客户文章示例: 【1】Nobutaka Mitsuda,Miho Ikeda,Shinobu Takada,et al.Efficient Yeast One-/Two-Hybrid Screening Using a Library Composed Only of Transcription Factors in Arabidopsis thaliana.Plant Cell Physiol (2010) 51 (12): 2145-2151. 【2】Chang-Qing Yang1, Xin Fang1, Xiu-Ming Wu1, et al. Transcriptional Regulation of Plant Secondary Metabolism. Journal of Integrative Plant Biology 2012, 54 (10): 703–712 【3】Zejun Huang, Zhijin Zhang, Xiuling Zhang,et al. Tomato TERF1 modulates ethylene response and enhances osmotic stress tolerance by activating expression of downstream genes. FEBS Letters.Volume 573, Issues 1–3, 27 August 2004, Pages 110-116 【4】Deng X1, Guo D2, Yang S1, Shi M1, Chao J1, Li H2, Peng S2, Tian W1. Jasmonate signalling in the regulation of rubber biosynthesis in laticifer cells of rubber tree, Hevea brasiliensis. J Exp Bot. 2018 Jun 27;69(15):3559-3571. doi: 10.1093/jxb/ery169. 膜蛋白双杂交文库客户文章示例: 【1】Yasuyuki Nakamura, Jun Ishii, Akihiko Kondo. Rapid, Facile Detection of Heterodimer Partners for Target Human G-Protein-Coupled Receptors Using a Modified Split-Ubiquitin Membrane Yeast Two-Hybrid System.PLOS one. June 2013 , Volume 8 ,Issue 6. 【2】Zhe Ma, Hui Zhang, Junxi Zheng. Interaction between M-Like Protein and Macrophage Thioredoxin Facilitates Antiphagocytosis for Streptococcus equi ssp. Zooepidemicus.PLOS one. February 2012 ,Volume 7, Issue 2. 【3】Pratima Pandey and Singh Harbinder. The Caenorhabditis elegans D2-like dopamine receptor DOP-2 physically interacts with GPA-14, a Gαi subunit. Pandey and Harbinder Journal of Molecular Signaling 2012. 中文论文: 【1】张云云,周 君, 李 晔. 可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)酵母双杂交文库和铁结合蛋白真核表达载体的构建. 海洋与湖沼,44卷,第6期。 【2】欧阳沫, 唐潇,黄惜,袁红梅。巴西橡胶树HbICE1 基因酵母双杂交诱饵载体的构建及互作蛋白的筛选。植物科学学报,2016,34(2): 255~262. 【3】岳珊珊,夏来新。酵母双杂交筛选与果蝇C(2)M相互作用的蛋白。遗传,2015.11,37(11) 【4】专利:一种结合串联重复序列(TTTACAC)5的Dof蛋白质 |