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转录组测序
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产品介绍转录组测序(transcriptome sequencing)的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的mRNA的集合,可从整体水平研究基因功能以及基因结构,发现不同生理或者病理状态下细胞、组织或个体内差异表达的基因。目前已广泛应用于基础研究、分子育种、临床诊断和药物研发等领域。 测序平台Illumina HiSeq平台,Illumina NextSeq 500平台 分析内容
结果展示基因共表达网络分析:WGCNA(Weighted correlation network analysis)是相关性网络分析的一种。用于分析不同样品中高度相关的基因形成的模块、这些模块的表征基因(module eigengene)和关键节点基因(hub gene)、基因模块与表型之间的关系等。常用来寻找潜在的生物标记分子(biomarker)或治疗靶标。部分结果展示如下: SNP位点及覆盖度统计图 通过Circos 对测序结果作图,最外圈为拼接结果,从外到内依次为GC比、样品SNP、测序覆盖深度。 各组差异分析之间共有的差异基因矩阵图 对角线数字为每次差异分析的差异表达基因数量,其余方框中数字表示两次差异分析之间的共有差异基因数量。 组间共有差异基因网络调控图 组间共有差异基因分析,不同颜色的圆圈代表不同组的两两比较,并列出差异基因,交叉的部分代表不同组之间的共有差异基因。 |